パターンに使うトーンを編集したあとに、トーンの保存操作をしていない可能性があります。
パターンに使うトーンを編集したときは、パターンとは別にトーンを保存するか、パターンとトーンの両方を保存してください。 ※ シーケンサーは、トーン・ナンバーと位置のみを記憶します。
トーンの保存方法について、詳しくは「SH-4d リファレンス・マニュアル」の「トーン/パターンを保存する(WRITE MENU)」をご覧ください。