INIT PROGRAM ではピッチベンド・レバー/モジュレーション・レバーとホイール 1 /ホイール 2 の動きが同じになっています。

ホイール 1 / ホイール 2 に好きなパラメーターを割り当てる方法は、ホイール 1 / ホイール 2 のアサイン設定（SYSTEM 取扱説明書 P.17、PROGRAM パラメータガイド P.2）と MATRIX CTRL（Matrix Control パラメーターガイド P.5 ）による割り当ての二通りの方法があります。

ホイール 1 / ホイール 2 のアサイン設定を使えば簡単に割り当てが可能です。

ホイール 1 / ホイール 2 はそれぞれ同じようにパラメータを割り当てられますが、ホイールの位置を任意の場所で止めておけるホイール 2 にパラメータを割り当てるのがおすすめです。

MATRIX CTRL を使えばホイール 1 / 2 に複数のパラメーターを割り当てるなど、複雑な設定が可能です。
MATRIX CTRL を使った設定は、工場出荷時のプログラム A02 [AN S-Saw/Wh2] などプログラム名に [Wh2] が入っているものが参考になります。