はい、可能です。

AC-3 には、

LINE OUT ･･･ PAシステムや BOSS BRシリーズのレコーダーなどとの出力端子
G.AMP OUT ･･･ ギター・アンプ接続用出力端子

の 2つの出力端子があります。
ご質問のようなアンプの使い分けをするためには、LINE OUT、G.AMP OUT に、
図のように PA システムとギター用アンプを接続します。
AC-3 をオン／オフすると、図で示したように、出力は自動的に切り替わります。

エフェクト・オンの場合

CHECK インジケーターが点灯して、G.AMP OUT ジャックの出力はミュートされ、
LINE OUT ジャックの出力からはエフェクト音 （アコースティック･ギターのサウンド） が出力されます。

エフェクト・オフの場合

CHECK インジケーターは消灯して、G.AMP OUT ジャックの出力からギター音
が出力され、LINE OUT ジャックの出力はミュートされます。